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Atlas é o pequeno companheiro de P-body e um dos dois robôs que GLaDOS construiu para a Iniciativa De Teste Cooperativo, que foi feita para diminuir testes com humanos. GLaDOS criou a iniciativa de teste após Chell a matou da primeira vez, em Portal. Junto com P-body, os dois robôs encaram uma série de testes construídos por GLaDOS, utilizando muitos aspectos encontrados por Chell no modo single-player.
Durante as fazes finais do teste, GLaDOS revela que, ainda que a Iniciativa de Testes Cooperativos tem suas utilidades, ela precisa de humanos para testar pela ciência, não robôs. GLaDOS revela que há humanos guardados dentro dos complexos Aperture anciãos. Lá os robôs terão que navegar as velhas câmaras de teste e abrir o grande cofre contendo os humanos, de certa forma deixado no lugar com alguma forma de cofre criogenético. Ao fazer isso, eles 'salvam a ciência'.
